1、保税区与境外之间的货物流通实行真正的备案制度，海关对货物的手册管理转变为对企业实行账册管理，货物、物品从非保税区进入保税区，视同出关，凭出口报送单、外汇核销单、增值税发票即可办理出口退税手续,不必等到货物离境时办理。

2、进出货物不受数量限制；商品可拆散、储存、分级、分类、修理、再制造、重新包装、重新标鉴、清洗、销毁、与外国或国内商品混合或重新出口。

3、对进出区的经营活动不加限制，例如已纳税的进口货可以从纳税地进入区内与其他货物混合后，再免税进入纳税地等。