认定企业单位行贿罪的三个问题是：

1、企业单位行贿罪的犯罪主体必须是单位;

2、企业单位行贿罪在主观方面只能是直接故意，并且具有为本单位谋取不正当利益的目的;

3、企业单位行贿罪在客观方面表现为直接负责的主管人员或直接责任人员根据本单位的意志以单位名义实施的行贿行为。

【法律依据】

根据《刑法》第三百九十三条，单位为谋取不正当利益而行贿，或者违反国家规定，给予国家工作人员以回扣、手续费，情节严重的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处五年以下有期徒刑或者拘役。